网站设计和传统的软件用户界面设计是有区别的。大体上说，设计师必须放弃对界面的完全控制，让用户和他们的客户端软/硬件来决定一部分。
当然，网站设计和传统的用户界面设计(UI Design)还是有很多相似之处的：最基本一点，他们都是交互式系统，都属于软件设计范畴而不是物理设计范畴。
设备的多样性
在传统GUI设计里，你能够控制每一个像素：你制作一个对话框的时候，你可以确定它在用户屏幕上的真实尺寸。你知道你在为什么系统设计，你知道那里安装了什么字体。你知道典型的显示器尺寸有多大，操作系统的作者告诉你给窗口做装饰的规则。
在网站方面，所有的上述设想都土崩瓦解。用户可能通过一台传统的计算机访问网站，也可能在用一个WebTV，可用笔点击的手持式设备，或者是Nokia移动电话，甚至他们的汽车就是一个Internet设备。在传统设计里，笔记本电脑和高端工作站屏幕的区别可能只有六种。在网上，我们必须应付手持的设备和工作站的屏幕区别可能有上百种，Modem和T-3专线之间的区别可能有上千种。
任何一个网站设计在不同的设备上看起来都大不一样：显然，所见即所得已经不灵了，看上去不同是一个特点，而不是个毛病，因为最佳的用户经验是需要根据设备的不同特征予以适当得调节。很特别的或者很低端的设备，都严格的要求网站内容适应特定的平台。达到这一目标的唯一道路就是放弃对界面的完全控制，让他们的网页展现取决于页面描述、特殊设置和客户端设备特性的相互影响。
为每个不同的平台设计一个抽象的UI描述比听起来困难的多。基本的HTML法则可以给设计师提供一个实现他们创意的好方法，但是不能提供给他们所有的方法。一般都提倡把内容和描述分离，使用Style Sheets定义描述，但是这样做更利于信息内容本身而非交互操作。
用户控制导航
在传统的GUI设计中，设计师可以控制用户什么时候可以去哪儿。你不想让某个菜单项工作，你可以让他变灰。你可以扔出一个对话框中止计算机的运行，直到用户回答了你的问题。
在网上，用户从根本上控制了他或她自己的使用网页的行为。用户可以抄小路而不受设计师的任何影响：比如，用户可以从搜索引擎直接进入网站内部，而不必经过首页。用户还可以控制他们自己的书签菜单，并利用它建立起一个网站的个人化接口。
网站设计师需要配合并支持这种用户可控制的使用方式。有时你可以强制用户使用特定的路径，阻止他们链接某些页面，可这么做的网站就显得过分的专制、独裁。最好设计的可自由移动一些，比如，在每一页放一个链接到首页的图标，给那些直接进入该页的人提供一个返回首页的导航。
整体的一部分
传统的应用程序是一种封闭式的用户经验：尽管Windows系统允许应用程序相互切换并且可以同时运行多个程序，但是在任一时刻，用户其实是处于一个单一的应用程序之中，而且只有针对这个程序的命令和一些动作起作用。在每一个程序上用户都花过很长时间，并且在逐渐熟悉他们的特征和设计。
在网上，用户在不同的网站之间，不同的设计（也就是网站）之间跑来跑去，具有相当的流动性。很少有人见一个网站就花上几分钟去看。他们经常通过超链接从这个站跳到那个站。这种情况下，对于用户的感觉，所有的网站是一个整体，而不是某个特定的网站：也就是说，用户需要每一个网站的使用习惯都是一样的，都是他们对整个网络的使用习惯的一部分，而不是每个网站都有它不同的习惯。在可用性研究中，用户经常抱怨那些用法离谱的网站不好使。换句话说，网络已经变成了一个整体的概念，每一个网站都是这个概念的一部分。
当然，传统GUI也是某个整体的一部分，遵循（操作系统）厂商的设计规则是比较明智的。关键一点就是在网站设计各方面，个性化设计与整体设计之间的天平倾向了整体。但是我们没有已确立的网站设计规则，没人告诉你应该如何运用界面元素建立一个符合整体概念的网站。我积极拥护建议搞一套正式的网站设计约定出来。我对网站设计师的忠告就是，你的网站不是别人世界的中心：用户还要在网站跳来跳去，我们应该让他们用任何一个新网站的时候都感到方便。